Κατά την αποθήκευση, η μαλακή πέτρα απαιτεί στεγνό και καλά αεριζόμενο-περιβάλλον. Η υπερβολική υγρασία μπορεί να θέσει σε κίνδυνο την απόδοση των συνδετικών παραγόντων, προκαλώντας την απορρόφηση του νερού και τη διαστολή του υλικού ή με αποτέλεσμα τον αποχρωματισμό της επιφάνειας και την κηλίδα-μειώνοντας έτσι τη διάρκεια ζωής της μαλακής πέτρας. Κατά συνέπεια, η μαλακή πέτρα θα πρέπει να αποθηκεύεται σε αποθήκη μακριά από βροχοπτώσεις και με χαμηλά επίπεδα υγρασίας ή σε χώρο που καλύπτεται από αδιάβροχο φύλλο, για να αποτρέπεται η άμεση επαφή με στάσιμα νερά στο έδαφος.
Κατά την αποθήκευση μαλακής πέτρας, πρέπει επίσης να ληφθεί μέριμνα ώστε να αποφευχθεί η στοίβαξη πολύ ψηλά για παρατεταμένες περιόδους ή η ανομοιόμορφη στοίβαξή τους. Αν και τα πάνελ από μαλακή πέτρα είναι ελαφρύτερα από τη φυσική σκληρή πέτρα, το υπερβολικό ύψος στοίβαξης μπορεί να οδηγήσει σε ανομοιόμορφη κατανομή φορτίου στα κάτω στρώματα, οδηγώντας ενδεχομένως σε παραμόρφωση ή ρωγμές. Συνιστάται η στοίβαξη των πάνελ από μαλακή πέτρα επίπεδα σε σταθερές βάσεις στήριξης-φόρτωσης και η τοποθέτηση προστατευτικών αντικραδασμικών υλικών μεταξύ των πάνελ για την ελαχιστοποίηση της ζημιάς στην επιφάνεια που προκαλείται από τριβή και κρούση.
Επιπλέον, πρέπει να δοθεί προσοχή στις διακυμάνσεις της θερμοκρασίας κατά την αποθήκευση της μαλακής πέτρας. Η υπερβολική ζέστη ή το κρύο μπορεί να θέσει σε κίνδυνο τη σταθερότητα των συνδετικών παραγόντων, οδηγώντας σε υποβάθμιση της συνολικής απόδοσης του υλικού. Όποτε είναι εφικτό, η θερμοκρασία του περιβάλλοντος αποθήκευσης θα πρέπει να διατηρείται σχετικά σταθερή. Επιπλέον, η επιφάνεια της μαλακής πέτρας θα πρέπει να ελέγχεται περιοδικά για τυχόν σημάδια ρωγμών, υγρασίας ή ανάπτυξης μούχλας. Εφαρμόζοντας αυτά τα συνετή μέτρα αποθήκευσης, η ποιότητα της μαλακής πέτρας μπορεί να μεγιστοποιηθεί, παρέχοντας έτσι μια αξιόπιστη βάση για επακόλουθη κατασκευή και χρήση.